W Metroid Prime 4: Beyond nie ma zbyt wielu głównych sekretów do odkrycia, ponieważ gra jest zaskakująco liniowa, ale jedną z kluczowych i bardziej tajemniczych części gry jest przedmiot, z którym poznajesz bardzo, bardzo wcześnie.
Rozpoczynając eksplorację Fury Green, natrafisz na Altar of Legacy, dziwnie wyglądający obiekt tuż po centralnym obszarze, gdzie zostawiasz Maca, by bawił się starożytnymi reliktami obcych. To tutaj każą ci wypełnić ten przedmiot mnóstwem Green Energy Crystals ukrytych przed całym światem, ale co to właściwie oznacza i dlaczego miałbyś się tym zajmować?

Na początek, kryształy można znaleźć praktycznie wyłącznie na otwartych pustynnych terenach Sol Valley, nawet jeśli inaczej można by je spotkać tu i ówdzie. Możesz je zbierać, po prostu rozbijając je na Vi-O-La, a ruch powerslide jest szczególnie skuteczny, by trafić wszystkie kryształy jednym szybkim ruchem. Następnie wszystkie je przyjmujesz i dodajesz do swojej kolekcji, co wcale nie jest wyjaśnione, ile ich potrzebujesz do nagród, ile ich masz, ani ile ich jest w sumie na całym świecie. W menu jest grafika, ale nie jest ona konkretna...

W każdym razie rozbijasz te kryształy i zbierasz ich jak najwięcej, stopniowo wypełniając grafikę. Mac, jak lubi, psuje niespodziankę za każdym razem, gdy osiągniesz jakiś kamień milowy, więc wypatruj jego telefonów podczas jazdy Sol Valley, ale poza tym dobrym momentem na sprawdzenie jest to, gdy przekroczysz granice 25%, 50%, 75% i 100%. Są one częściowo zarysowane przez luki na grafice lub przez zmianę koloru z zielonego na jasnoniebieski (dzieje się to po 100% na zielonej grafice).
Gdy osiągniesz te kamienie milowe, możesz wrócić do Altar of Legacy i zgromadzić kryształy na niezwykle przydatne nagrody, które wpływają na twoje Psychic Beam, Control Beam i zbroję.

Ulepszenie Psychic Beam sprawia, że twoje strzały lecą szybciej i zadają więcej obrażeń, co jest bardzo pomocne w miarę postępów w grze. Ulepszenie Control Beam jest podobne, ponieważ pocisk teraz leci szybciej, co czyni go równie użytecznym, ale prawdziwą kulminą jest Legacy Suit.
To srebrno-zbroja dla Samus Aran, która wprowadza kilka ulepszeń, w tym nową funkcję, która może wywołać ochronną barierę wokół Samus poprzez naciśnięcie i przytrzymanie R za koszt 35 Missile Ammo. Drugą cechą jest ulepszenie wizjera Samus ', który tworzy efekt kompasu pokazujący, kiedy jesteś blisko Green Energy Crystals w Sol Valley. W zasadzie ułatwia to znalezienie przeoczonych kryształów.
No i oto to wszystko. Dlatego zdecydowanie powinieneś zbierać Green Energy Crystals i dalej wypełniać Altar of Legacy, mimo że potrafi być to ogłupiająco nudne – przemierzanie pustyni i rozbijanie kryształów...